O processo eleitoral foi marcado por semanas de análises documentais, impugnações recíprocas e debates sobre a regularidade das candidaturas. A Comissão Eleitoral independente, formada pelo Centro Brasileiro de Mediação e Arbitragem (CBMA), analisou todos os questionamentos e decidiu homologar ambas as chapas, considerando inexistentes impedimentos legais.

O colégio eleitoral também passou por ajuste. Inicialmente composto por 27 entidades, o grupo foi ampliado para 28 após a inclusão do Paulistano Futebol Clube, autorizada pelo CBMA. A decisão levou em conta que o clube participou de competição na temporada anterior, mesmo tendo desistido da Segunda Divisão de 2024 e sido punido esportivamente.

Participaram da votação clubes das Séries A e B do Campeonato Mato-grossense, entre eles os tradicionais Cuiabá, Dom Bosco, Mixto, Operário VG, União e Luverdense, além da liga esportiva de Alta Floresta.

O processo eleitoral da FMF estava suspenso desde maio de 2025 em decorrência de uma série de questionamentos judiciais. Durante o período de intervenção conduzido pelo Centro Brasileiro de Mediação e Arbitragem (CBMA), foi criada uma Comissão Eleitoral Apartada e Independente, responsável por validar candidaturas, analisar impugnações e organizar todas as etapas que levaram à votação desta terça-feira. O edital foi reaberto em novembro, com a inscrição e aprovação das novas chapas, culminando na eleição que confirmou Diogo Pécora como presidente.